Solidot | 测序人类基因只需一周时间 - http://science.solidot.org/article...
Jul 15, 2009
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ThenWang
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人类基因组计划花了13年时间耗资数十亿美元才完成单一人类基因组的完整测序。在华盛顿大学基因中心,研究人员现在能在一周时间内完成一个人的基因测序。但当你创造出如何多的数据时,仅仅是进行跟踪便成为一项重大的挑战。David Dooling主管基因测序机器的大规模数据输出,数据向中心和世界各地的研究人员开放。David Dooling谈论了开源软件在测序中的应用,及基因测序的现状和研究发展。
Dooling称现有的测序数据光公开在线上的便高达3Petabytes之多,他们的计算机集群有3000多个核心,测试仪器每天产生数十Terabytes的数据,他们参与多种不同的测序项目,如人类基因组计划,随后的老鼠基因组测序项目等等。去年他们发表了完整的癌症基因序列,识别出癌症基因和正常基因的差异,并开始着手寻找个体内癌症产生的原因。
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